مرحوم مشكينى در حاشيه فرموده : شيخ اعظم در اوايل رسايل قائل به مغايرت شده و دليل را مخصوص احكام دانسته ( حجت ظنى معتبر در احكام را دليل گويند مثل خبر ثقه و استصحاب . . . ) و اماره را مخصوص موضوعات دانسته ( حجت معتبر ظنى در موضوعات را اماره گويند مثل شهادت دو عادل و شايد منظور آخوند همين مغايرت باشد و لذا هر دو را آورده . شايد به قول مرحوم مشكينى نظر به عدم مغايرت دارند و مىخواهند تعريض به شيخ اعظم داشته باشند كه اين‌ها مغاير نيستند و متحد المعنى مىباشند و هر دو هم در موضوعات و هم در احكام به كار مىروند و اصطلاح مغايرت ، اصطلاح مخصوص شيخ است .